Povinnost uvádění biokomponent na trh je v České republice stanovena zákonem č. 180/2007 Sb., kterým se mění zákon č. 86/2002 Sb., o ochraně ovzduší. Podle zákona č. 180/2007 Sb. jsou povinnými osobami subjekty, které uvádějí motorové benziny a motorovou naftu, schválené pro provoz na pozemních komunikacích, do volného daňového oběhu pro tuzemský trh. V praxi to jsou tedy výrobci motorových paliv, rafinérie, provozovatelé daňových skladů, dovozci paliv a někteří distributoři, tj. rafinérie Litvínov a Kralupy ČESKÉ RAFINÉRSKÉ, a.s., rafinérie PARAMO, a.s., Pardubice, a devět rozhodujících terminálů největšího distributora paliv, ČEPRO, a.s., a další menší subjekty působící na trhu v ČR.
V souladu s českou legislativou k využívaní biopaliv v dopravě (zákon o ochraně ovzduší) a českými a evropskými technickými normami pro motorová paliva petrolejářský průmysl (ČESKÁ RAFINÉRSKÁ a PARAMO) zahájil mísení biopaliv do fosilních motorových paliv od 1. 9. 2007. Společnost ČEPRO zahájila mísení biopaliv pilotním projektem v červnu 2006.
Převážně používanými biopalivy jsou bioetanol (kvasný líh zvláště denaturovaný) a etyltercbutyléter (ETBE) do benzinu a metylestery mastných kyselin (FAME) anebo metylestery řepkového oleje (MEŘO) do motorové nafty.
Zařízení na mísení biopaliv, tj. metylesterů mastných kyselin (FAME), v tuzemsku pak hlavně metylesterů řepkového oleje (MEŘO) a bioetanolu, do motorových paliv byla v těchto podnicích vybudována a odzkoušena v předstihu v roce 2006.
Biopaliva jsou do motorových paliv přidávána v průběhu jejich mísení nebo na skladových terminálech. V obou případech však výrobce finálního produktu musí garantovat jakost automobilového benzinu a motorové nafty a prověřit i jakost biopaliv jak metylesterů řepkového oleje, tak bioetanolu včetně vhodných skladovacích podmínek.